《云中歌》承接了上部著作《大漠谣》的故事布景，叙述西汉时期，霍去病与金玉的女儿霍云歌与汉昭帝刘弗陵和文人孟珏的爱情故事。
西汉时期，八岁的汉昭帝刘弗陵被追逼到万里荒漠，穷途末路之际，一个骑着天山雪驼的绿衫女孩云歌随便来临，将其带出荒漠。冷酷似冰的刘弗陵终究被精灵心爱的云歌感动，互赠礼物后相约十年后的长安相会。
十年后，云歌带着儿时的许诺来到长安寻觅刘弗陵，无法此刻的刘哥哥不只不记得儿时的大漠许诺，并且身边还多了个贤惠美丽的女子许平君。悲伤的云歌正欲回来西漠，却遇上了难缠的绝世美男孟珏，云歌认为美好的日子从此开端，谁知又卷入了一场宫殿王位之争。